Россельхознадзором разработан, утверждён 27 мая 2009 года и согласован с Федеральной таможенной службой 4 июня новый Перечень подкарантинной продукции, подлежащей государственному карантинному фитосанитарному контролю, который вступил в силу с 15 июля 2009 года. Перечень основан на осуществляемом с 2005 года мониторинге подкарантинной продукции при проведении государственного карантинного фитосанитарного контроля в пунктах пропуска через государственную границу Российской Федерации, а также на основании проведенных ФГУ «ВНИИКР» лабораторных экспертиз, в результате которых выделены группы товаров, такие, например, как мука тонкого и грубого помола из мяса, рыбы, пески природные всех видов, галька, гравий, щебень, в которых карантинные объекты практически не выявлялись, в связи с чем они не были включены в итоговый документ.

Вместе с тем, в 2007 и 2008 годах при проведении досмотра выявлено 4290 единиц техники с обнаружениями биологических материалов и почвы, насекомых в живом и мертвом виде. Зарегистрировано 14 случаев обнаружения опасных карантинных объектов – азиатской хлопковой совки, американской белой бабочки, непарного шелкопряда, японского жука. В этой связи транспортные средства, бывшие в эксплуатации, включены в Перечень. Так, фитосанитарному контролю подвергнутся все транспортные средства, в частности, легковые и грузовые автомобили, спецтехника: тракторы, автокраны, снегоочистители и снегораздувающие машины, пожарная техника, машины, предназначенные для медицинских целей. Техника будет дважды проходить фитосанитарный контроль — на границе и в месте назначения. Досмотр будет осуществляться сотрудниками Россельхознадзора и его территориальных управлений, в частности сотрудниками Управления Россельхознадзора по Тверской и Псковской областям.

При ввозе подкарантинной продукции, отгруженной до 15 июля 2009 года, действует ранее разработанная Россельхознадзором и согласованной с ФТС России номенклатура товаров, подлежащих карантинному фитосанитарному контролю от 11.12.2006.